SSH指定校一覧 各校のHPにリンクしています
| 平成15～17年度 指定 | 平成16～18年度 指定 | 平成17～22年度 指定 | ||||||
| 都道府県 | 学校種 | 学校名 | 都道府県 | 学校種 | 学校名 | 都道府県 | 学校種 | 学校名 |
| 北海道 | 道立 | 帯広柏葉 | 福島県 | 県立 | 相馬 | 青森県 | 県立 | 八戸北 |
| 岩手県 | 県立 | 水沢 | 埼玉県 | 県立 | 浦和第一女子 | 群馬県 | 県立 | 高崎 |
| 秋田県 | 県立 | 大館鳳鳴 | 千葉県 | 県立 | 柏 | 埼玉県 | 県立 | 大宮 |
| 茨城県 | 県立 | 竹園 | 千葉県 | 私立 | 芝浦工業大学柏 | 埼玉県 | 私立 | 早稲田大学本庄 |
| 栃木県 | 県立 | 宇都宮 | 東京都 | 都立 | 戸山 | 東京都 | 国立 | 東京工業大学附属科学技術 |
| 群馬県 | 県立 | 高崎女子 | 東京都 | 私立 | 東海大学付属高輪台 | 神奈川県 | 県立 | 西湘 |
| 神奈川県 | 私立 | 慶應義塾 | 石川県 | 県立 | 七尾 | 山梨県 | 県立 | 都留 |
| 新潟県 | 県立 | 新潟南 | 福井県 | 県立 | 藤島 | 長野県 | 県立 | 諏訪清陵 |
| 富山県 | 県立 | 高岡 | 山梨県 | 県立 | 甲府南 | 京都府 | 京都市立 | 堀川 |
| 石川県 | 県立 | 金沢泉丘 | 岐阜県 | 県立 | 恵那 | 京都府 | 私立 | 立命館 |
| 福井県 | 県立 | 高志 | 静岡県 | 県立 | 清水東 | 京都府 | 国立 | 京都教育大学附属 |
| 長野県 | 県立 | 屋代 | 三重県 | 県立 | 松阪 | 兵庫県 | 県立 | 尼崎小田 |
| 岐阜県 | 県立 | 岐山 | 滋賀県 | 県立 | 彦根東 | 奈良県 | 国立 | 奈良女子大学附属中等教育 |
| 静岡県 | 県立 | 磐田南 | 京都府 | 府立 | 洛北 | 岡山県 | 県立 | 倉敷天城 |
| 愛知県 | 県立 | 一宮 | 大阪府 | 府立 | 天王寺 | 広島県 | 県立 | 広島国泰寺 |
| 三重県 | 県立 | 四日市 | 兵庫県 | 県立 | 神戸 | 愛媛県 | 県立 | 松山南 |
| 和歌山県 | 県立 | 桐蔭 | 奈良県 | 県立 | 奈良 | 福岡県 | 県立 | 小倉 |
| 鳥取県 | 県立 | 鳥取東 | 和歌山 県 | 県立 | 海南 | 長崎県 | 県立 | 長﨑西 |
| 島根県 | 県立 | 松江東 | 島根県 | 県立 | 益田 | 大分県 | 県立 | 大分舞鶴 |
| 広島県 | 国立 | 広島大学附属 | 山口県 | 県立 | 山口 | 鹿児島県 | 県立 | 錦江湾 |
| 山口県 | 県立 | 岩国 | 鹿児島県 | 私立 | 池田学園池田 | |||
| 徳島県 | 県立 | 城南 | 沖縄県 | 県立 | 開邦 | |||
| 香川県 | 県立 | 三本松 | ||||||
| 長崎県 | 県立 | 諫早 | ||||||
| 熊本県 | 県立 | 第二 | ||||||
| 宮崎県 | 県立 | 宮崎北 | ||||||